La colangiojejunostomia ha subito oltre 130 anni di continui miglioramenti e sviluppi. Dalla prima colecistojjunostomia, si sono gradualmente evolute l'anastomosi colecisto-duodenale, l'anastomosi biliare-duodenale e l'anastomosi ileo-biliare a ponte con anastomosi Roux-en-Y, l'anastomosi a loop ileale del dotto biliare, l'anastomosi porto-ileale di Kasai, il drenaggio a ponte con tubo a T del dotto biliare nell'ileo, l'otturazione dello sfintere di Oddi e l'anastomosi ileo-biliare modificata. Nessuna delle tecniche sopra menzionate riesce a risolvere perfettamente tutti i problemi.

Ad esempio, l'anastomosi colecistico-ileale, sebbene la colecisti sia più facilmente accessibile durante l'intervento, riducendo così il tempo operatorio e la difficoltà dell'operazione, può causare facilmente l'ostruzione del sottile dotto cistico a causa del reflusso del contenuto intestinale e aumentare l'incidenza della colangite da reflusso. Di conseguenza, l'applicazione clinica di questa metodica chirurgica sta gradualmente diminuendo. L'anastomosi colecisto-duodenale, l'anastomosi biliare-duodenale e l'anastomosi ileo-biliare a ponte con duodeno come estremità laterale dell'anastomosi facilitano il reflusso del contenuto duodenale nel dotto biliare, causando colangite da reflusso. Anche se l'anastomosi biliare-duodenale può ottenere un'anastomosi laterale su entrambe le estremità, ciò inevitabilmente porta all'accumulo di contenuti reflussivi all'estremità del dotto biliare e provoca infiammazioni ripetute; pertanto, queste procedure sono quasi abbandonate nella pratica clinica. 

Il drenaggio a ponte con tubo a T del dotto biliare nell'ileo è spesso un trattamento palliativo per pazienti con ostruzione biliare maligna che sono anziani, in cattive condizioni fisiche e incapaci di affrontare interventi chirurgici prolungati. Oggi, con la crescente maturità della tecnologia endoscopica, anche l'otturazione dello sfintere di Oddi è stata sostituita dal trattamento endoscopico. Tuttavia, l'anastomosi porto-ileale di Kasai è difficile da realizzare con una semplice corrispondenza tra tessuto biliare e mucosa intestinale, il che porta inevitabilmente a un aumento della probabilità di stenosi anastomotica e ne limita quindi l'uso clinico. Tuttavia, nel trattamento chirurgico del colangiocarcinoma hilarico, l'anastomosi hilar-ileale di Kasai è una delle procedure più comunemente utilizzate. Sebbene l'anastomosi ileo-biliare garantisca l'integrità dell'intestino, il passaggio di cibo attraverso l'anastomosi biliare persiste e la colangite da reflusso non può essere evitata. 

Alcuni studiosi hanno progettato un'anastomosi ileo-biliare a loop migliorata. Poiché l'ileo tra le due anastomosi viene legato con un filo, teoricamente si evita il passaggio del contenuto intestinale attraverso l'anastomosi biliare-enterica. Allo stesso tempo, alcuni studiosi utilizzano questa tecnica come anastomosi biliare-enterica di prima scelta e hanno ottenuto buoni risultati clinici. L'anastomosi biliare-ileale Roux-en-Y è attualmente la procedura più riconosciuta e più utilizzata nell'anastomosi biliare-enterica. Questa operazione può efficacemente ridurre l'insorgenza di colangite da reflusso estendendo il ramo biliare e il loop intestinale. Alcuni studiosi hanno seguito più di 1.000 pazienti sottoposti a colangiojejunostomia. Tra le tre diverse colangiojejunostomie, l'incidenza di colangiocarcinoma dopo la colangiojejunostomia Roux-en-Y è la più bassa.

Tuttavia, ci sono anche segnalazioni in letteratura secondo cui l'incidenza di complicanze vascolari (trombosi dell'arteria epatica e trombosi della vena porta) dopo l'anastomosi Roux-en-Y del dotto biliare-ileo è aumentata, il che dimostra ancora una volta che questa procedura presenta ancora dei limiti. In questa fase, non esiste un'anastomosi biliare-enterica perfetta, ma l'anastomosi biliare-ileale Roux-en-Y è stata ampiamente riconosciuta e accettata come procedura di riferimento nell'anastomosi biliare-enterica. Allo stesso tempo, l'autore ritiene che, se l'anastomosi ileo-biliare modificata a loop sarà confermata da una vasta esperienza clinica, essa merita anch'essa di essere raccomandata.

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